无尽的拉格朗日中，主武器是舰船核心输出系统，负责主要伤害与核心战术功能；副武器为辅助输出或防空/补伤害系统，优先级与面板占比明显低于主武器。
区分主副武器最直接的方式是查看蓝图界面的武器系统标签，主武器通常标注为“主武器系统”，在界面中排序靠前，占据核心位置，且单发伤害、每分钟伤害（DPM）或战略价值最高。例如战列舰的攻坚轨道炮、驱逐舰的主炮脉冲炮塔、护卫舰的无人机攻击系统，均为典型主武器。副武器多标注为“副武器/防空/辅助武器”，排序靠后，伤害更低，功能偏向补刀、防空或特殊工况应对。
从功能定位看，主武器决定舰船核心战术价值，负责对舰、对建筑的主要伤害，部分自带关键武器策略，如聚能爆发、锁定强化等，可显著改变战局。副武器则承担次要对舰火力、防空拦截、反小型舰船或应急补伤任务，不影响舰船核心定位，升级收益也远低于主武器。例如斗牛级驱逐舰的BP-600T脉冲主炮是核心输出，而3组BP-120B副炮仅用于补伤与防空。
资源分配优先级是区分主副武器的关键实战依据。技术值、调校点优先投入主武器，优先点满伤害、冷却缩减、命中率等核心属性，最大化核心输出。副武器仅在主武器成型后酌情加点，通常只点基础伤害或射速，无需投入高价值资源。如枪骑兵驱逐舰优先强化风暴导弹主武器的冷却与伤害，副武器重炮仅少量加点补充火力。
索敌与攻击逻辑也能辅助区分。主武器多为直射或高优先级制导武器，索敌稳定，优先攻击敌方关键目标；副武器常为近防、速射或防空武器，索敌范围小，优先拦截战机、护航艇或近距离小型舰船。部分舰船主武器可锁定中后排大型目标，副武器则专注清理前排杂兵，分工明确。
